Protein–RNA interactions for Protein: Q60960

Kpna1, Importin subunit alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna1Q60960 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kpna1Q60960 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Kpna1Q60960 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Kpna1Q60960 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kpna1Q60960 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kpna1Q60960 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Kpna1Q60960 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Kpna1Q60960 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Kpna1Q60960 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Kpna1Q60960 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Kpna1Q60960 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kpna1Q60960 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kpna1Q60960 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kpna1Q60960 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kpna1Q60960 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kpna1Q60960 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kpna1Q60960 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kpna1Q60960 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Kpna1Q60960 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kpna1Q60960 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kpna1Q60960 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Kpna1Q60960 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kpna1Q60960 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Kpna1Q60960 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Kpna1Q60960 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Kpna1Q60960 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kpna1Q60960 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kpna1Q60960 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kpna1Q60960 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kpna1Q60960 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Kpna1Q60960 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Kpna1Q60960 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kpna1Q60960 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Kpna1Q60960 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kpna1Q60960 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kpna1Q60960 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kpna1Q60960 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kpna1Q60960 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kpna1Q60960 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kpna1Q60960 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kpna1Q60960 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kpna1Q60960 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kpna1Q60960 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Kpna1Q60960 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Kpna1Q60960 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kpna1Q60960 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Kpna1Q60960 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kpna1Q60960 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kpna1Q60960 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kpna1Q60960 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kpna1Q60960 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kpna1Q60960 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kpna1Q60960 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kpna1Q60960 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kpna1Q60960 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kpna1Q60960 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Kpna1Q60960 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Kpna1Q60960 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Kpna1Q60960 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Kpna1Q60960 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Kpna1Q60960 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Kpna1Q60960 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Kpna1Q60960 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms