Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grik1Q60934 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Grik1Q60934 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Grik1Q60934 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grik1Q60934 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grik1Q60934 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Grik1Q60934 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grik1Q60934 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grik1Q60934 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Grik1Q60934 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grik1Q60934 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grik1Q60934 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Grik1Q60934 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grik1Q60934 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grik1Q60934 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Grik1Q60934 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Grik1Q60934 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grik1Q60934 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Grik1Q60934 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Grik1Q60934 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Grik1Q60934 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grik1Q60934 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Grik1Q60934 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grik1Q60934 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grik1Q60934 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grik1Q60934 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grik1Q60934 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Grik1Q60934 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grik1Q60934 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grik1Q60934 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grik1Q60934 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Grik1Q60934 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Grik1Q60934 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Grik1Q60934 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Grik1Q60934 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik1Q60934 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik1Q60934 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik1Q60934 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik1Q60934 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Grik1Q60934 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Grik1Q60934 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Grik1Q60934 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Grik1Q60934 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grik1Q60934 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grik1Q60934 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Grik1Q60934 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Grik1Q60934 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Grik1Q60934 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik1Q60934 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Grik1Q60934 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grik1Q60934 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Grik1Q60934 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grik1Q60934 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grik1Q60934 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Grik1Q60934 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grik1Q60934 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Grik1Q60934 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Grik1Q60934 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grik1Q60934 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grik1Q60934 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grik1Q60934 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Grik1Q60934 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Grik1Q60934 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grik1Q60934 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms