Protein–RNA interactions for Protein: Q5UBV8

Tnfsf15, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 15, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Tnfsf15Q5UBV8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tnfsf15Q5UBV8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnfsf15Q5UBV8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tnfsf15Q5UBV8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms