Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tsr1Q5SWD9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tsr1Q5SWD9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tsr1Q5SWD9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tsr1Q5SWD9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tsr1Q5SWD9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tsr1Q5SWD9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tsr1Q5SWD9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Tsr1Q5SWD9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tsr1Q5SWD9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsr1Q5SWD9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsr1Q5SWD9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsr1Q5SWD9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsr1Q5SWD9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tsr1Q5SWD9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tsr1Q5SWD9 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tsr1Q5SWD9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tsr1Q5SWD9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tsr1Q5SWD9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tsr1Q5SWD9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tsr1Q5SWD9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tsr1Q5SWD9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tsr1Q5SWD9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tsr1Q5SWD9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tsr1Q5SWD9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tsr1Q5SWD9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tsr1Q5SWD9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tsr1Q5SWD9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tsr1Q5SWD9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tsr1Q5SWD9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tsr1Q5SWD9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tsr1Q5SWD9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tsr1Q5SWD9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tsr1Q5SWD9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tsr1Q5SWD9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tsr1Q5SWD9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tsr1Q5SWD9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tsr1Q5SWD9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tsr1Q5SWD9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tsr1Q5SWD9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tsr1Q5SWD9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tsr1Q5SWD9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tsr1Q5SWD9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tsr1Q5SWD9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tsr1Q5SWD9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tsr1Q5SWD9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tsr1Q5SWD9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Tsr1Q5SWD9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tsr1Q5SWD9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms