Protein–RNA interactions for Protein: Q5SS00

Zdbf2, DBF4-type zinc finger-containing protein 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdbf2Q5SS00 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Zdbf2Q5SS00 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zdbf2Q5SS00 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Zdbf2Q5SS00 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zdbf2Q5SS00 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zdbf2Q5SS00 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Zdbf2Q5SS00 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Zdbf2Q5SS00 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Zdbf2Q5SS00 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zdbf2Q5SS00 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zdbf2Q5SS00 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zdbf2Q5SS00 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zdbf2Q5SS00 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Zdbf2Q5SS00 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zdbf2Q5SS00 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zdbf2Q5SS00 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Zdbf2Q5SS00 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zdbf2Q5SS00 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zdbf2Q5SS00 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Zdbf2Q5SS00 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Zdbf2Q5SS00 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Zdbf2Q5SS00 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zdbf2Q5SS00 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Zdbf2Q5SS00 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
Zdbf2Q5SS00 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Zdbf2Q5SS00 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zdbf2Q5SS00 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Zdbf2Q5SS00 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Zdbf2Q5SS00 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Zdbf2Q5SS00 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zdbf2Q5SS00 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Zdbf2Q5SS00 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zdbf2Q5SS00 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zdbf2Q5SS00 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Zdbf2Q5SS00 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Zdbf2Q5SS00 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zdbf2Q5SS00 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zdbf2Q5SS00 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zdbf2Q5SS00 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zdbf2Q5SS00 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Zdbf2Q5SS00 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zdbf2Q5SS00 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Zdbf2Q5SS00 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Zdbf2Q5SS00 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Zdbf2Q5SS00 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zdbf2Q5SS00 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zdbf2Q5SS00 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Zdbf2Q5SS00 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Zdbf2Q5SS00 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zdbf2Q5SS00 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Zdbf2Q5SS00 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zdbf2Q5SS00 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Zdbf2Q5SS00 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zdbf2Q5SS00 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zdbf2Q5SS00 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zdbf2Q5SS00 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Zdbf2Q5SS00 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zdbf2Q5SS00 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Zdbf2Q5SS00 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Zdbf2Q5SS00 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Zdbf2Q5SS00 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zdbf2Q5SS00 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zdbf2Q5SS00 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zdbf2Q5SS00 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Zdbf2Q5SS00 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zdbf2Q5SS00 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Zdbf2Q5SS00 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zdbf2Q5SS00 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Zdbf2Q5SS00 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zdbf2Q5SS00 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zdbf2Q5SS00 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Zdbf2Q5SS00 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Zdbf2Q5SS00 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zdbf2Q5SS00 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zdbf2Q5SS00 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Zdbf2Q5SS00 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zdbf2Q5SS00 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Zdbf2Q5SS00 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zdbf2Q5SS00 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zdbf2Q5SS00 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Zdbf2Q5SS00 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Zdbf2Q5SS00 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zdbf2Q5SS00 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Zdbf2Q5SS00 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Zdbf2Q5SS00 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zdbf2Q5SS00 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Zdbf2Q5SS00 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Zdbf2Q5SS00 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Zdbf2Q5SS00 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zdbf2Q5SS00 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Zdbf2Q5SS00 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Zdbf2Q5SS00 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms