Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rtl5Q5DTT4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rtl5Q5DTT4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Rtl5Q5DTT4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Rtl5Q5DTT4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rtl5Q5DTT4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rtl5Q5DTT4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rtl5Q5DTT4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Rtl5Q5DTT4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rtl5Q5DTT4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Rtl5Q5DTT4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rtl5Q5DTT4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Rtl5Q5DTT4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rtl5Q5DTT4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rtl5Q5DTT4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rtl5Q5DTT4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rtl5Q5DTT4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rtl5Q5DTT4 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rtl5Q5DTT4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rtl5Q5DTT4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rtl5Q5DTT4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rtl5Q5DTT4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Rtl5Q5DTT4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Rtl5Q5DTT4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Rtl5Q5DTT4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Rtl5Q5DTT4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rtl5Q5DTT4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rtl5Q5DTT4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rtl5Q5DTT4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Rtl5Q5DTT4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Rtl5Q5DTT4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rtl5Q5DTT4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Rtl5Q5DTT4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rtl5Q5DTT4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rtl5Q5DTT4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rtl5Q5DTT4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Rtl5Q5DTT4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Rtl5Q5DTT4 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Rtl5Q5DTT4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Rtl5Q5DTT4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
Rtl5Q5DTT4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rtl5Q5DTT4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
Rtl5Q5DTT4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rtl5Q5DTT4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rtl5Q5DTT4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Rtl5Q5DTT4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rtl5Q5DTT4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rtl5Q5DTT4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Rtl5Q5DTT4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Rtl5Q5DTT4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Rtl5Q5DTT4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.73
Rtl5Q5DTT4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
Rtl5Q5DTT4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
Rtl5Q5DTT4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Rtl5Q5DTT4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rtl5Q5DTT4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Rtl5Q5DTT4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rtl5Q5DTT4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rtl5Q5DTT4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rtl5Q5DTT4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rtl5Q5DTT4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Rtl5Q5DTT4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rtl5Q5DTT4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rtl5Q5DTT4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
Rtl5Q5DTT4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rtl5Q5DTT4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rtl5Q5DTT4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Rtl5Q5DTT4 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rtl5Q5DTT4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Rtl5Q5DTT4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Rtl5Q5DTT4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms