Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc27a5Q4LDG0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a5Q4LDG0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a5Q4LDG0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a5Q4LDG0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a5Q4LDG0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a5Q4LDG0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc27a5Q4LDG0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc27a5Q4LDG0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc27a5Q4LDG0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc27a5Q4LDG0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc27a5Q4LDG0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc27a5Q4LDG0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a5Q4LDG0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a5Q4LDG0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a5Q4LDG0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc27a5Q4LDG0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc27a5Q4LDG0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc27a5Q4LDG0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc27a5Q4LDG0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc27a5Q4LDG0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a5Q4LDG0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc27a5Q4LDG0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc27a5Q4LDG0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc27a5Q4LDG0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc27a5Q4LDG0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc27a5Q4LDG0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc27a5Q4LDG0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc27a5Q4LDG0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc27a5Q4LDG0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc27a5Q4LDG0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a5Q4LDG0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a5Q4LDG0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a5Q4LDG0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a5Q4LDG0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc27a5Q4LDG0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc27a5Q4LDG0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc27a5Q4LDG0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc27a5Q4LDG0 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc27a5Q4LDG0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc27a5Q4LDG0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc27a5Q4LDG0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc27a5Q4LDG0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc27a5Q4LDG0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc27a5Q4LDG0 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc27a5Q4LDG0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc27a5Q4LDG0 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc27a5Q4LDG0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a5Q4LDG0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc27a5Q4LDG0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a5Q4LDG0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a5Q4LDG0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a5Q4LDG0 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a5Q4LDG0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc27a5Q4LDG0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc27a5Q4LDG0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a5Q4LDG0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a5Q4LDG0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc27a5Q4LDG0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc27a5Q4LDG0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc27a5Q4LDG0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc27a5Q4LDG0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc27a5Q4LDG0 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a5Q4LDG0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a5Q4LDG0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a5Q4LDG0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc27a5Q4LDG0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a5Q4LDG0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a5Q4LDG0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a5Q4LDG0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a5Q4LDG0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a5Q4LDG0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a5Q4LDG0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a5Q4LDG0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a5Q4LDG0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a5Q4LDG0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a5Q4LDG0 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a5Q4LDG0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc27a5Q4LDG0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc27a5Q4LDG0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms