Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1V3

Esf1, ESF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esf1Q3V1V3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC41.22■■■■■ 4.19
Esf1Q3V1V3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.22■■■■■ 4.19
Esf1Q3V1V3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
Esf1Q3V1V3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC41.19■■■■■ 4.18
Esf1Q3V1V3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Esf1Q3V1V3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Esf1Q3V1V3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
Esf1Q3V1V3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
Esf1Q3V1V3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
Esf1Q3V1V3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
Esf1Q3V1V3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC41.15■■■■■ 4.18
Esf1Q3V1V3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Esf1Q3V1V3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
Esf1Q3V1V3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
Esf1Q3V1V3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Esf1Q3V1V3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
Esf1Q3V1V3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Esf1Q3V1V3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC41.13■■■■■ 4.17
Esf1Q3V1V3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
Esf1Q3V1V3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC41.11■■■■■ 4.17
Esf1Q3V1V3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Esf1Q3V1V3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Esf1Q3V1V3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.07■■■■■ 4.16
Esf1Q3V1V3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
Esf1Q3V1V3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
Esf1Q3V1V3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
Esf1Q3V1V3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
Esf1Q3V1V3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
Esf1Q3V1V3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
Esf1Q3V1V3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
Esf1Q3V1V3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Esf1Q3V1V3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
Esf1Q3V1V3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.98■■■■■ 4.15
Esf1Q3V1V3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
Esf1Q3V1V3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.97■■■■■ 4.15
Esf1Q3V1V3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC40.96■■■■■ 4.15
Esf1Q3V1V3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Esf1Q3V1V3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC40.96■■■■■ 4.15
Esf1Q3V1V3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Esf1Q3V1V3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Esf1Q3V1V3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Esf1Q3V1V3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Esf1Q3V1V3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Esf1Q3V1V3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
Esf1Q3V1V3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Esf1Q3V1V3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
Esf1Q3V1V3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC40.93■■■■■ 4.14
Esf1Q3V1V3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
Esf1Q3V1V3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Esf1Q3V1V3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Esf1Q3V1V3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Esf1Q3V1V3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Esf1Q3V1V3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
Esf1Q3V1V3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
Esf1Q3V1V3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
Esf1Q3V1V3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC40.88■■■■■ 4.14
Esf1Q3V1V3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
Esf1Q3V1V3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
Esf1Q3V1V3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Esf1Q3V1V3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Esf1Q3V1V3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.13
Esf1Q3V1V3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Esf1Q3V1V3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
Esf1Q3V1V3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
Esf1Q3V1V3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC40.8■■■■■ 4.12
Esf1Q3V1V3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.79■■■■■ 4.12
Esf1Q3V1V3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Esf1Q3V1V3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
Esf1Q3V1V3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
Esf1Q3V1V3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Esf1Q3V1V3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Esf1Q3V1V3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
Esf1Q3V1V3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
Esf1Q3V1V3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC40.75■■■■■ 4.11
Esf1Q3V1V3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC40.75■■■■■ 4.11
Esf1Q3V1V3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Esf1Q3V1V3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
Esf1Q3V1V3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Esf1Q3V1V3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Esf1Q3V1V3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Esf1Q3V1V3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Esf1Q3V1V3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC40.72■■■■■ 4.11
Esf1Q3V1V3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Esf1Q3V1V3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC40.7■■■■■ 4.11
Esf1Q3V1V3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Esf1Q3V1V3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
Esf1Q3V1V3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Esf1Q3V1V3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
Esf1Q3V1V3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Esf1Q3V1V3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
Esf1Q3V1V3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC40.68■■■■■ 4.1
Esf1Q3V1V3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
Esf1Q3V1V3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
Esf1Q3V1V3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
Esf1Q3V1V3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
Esf1Q3V1V3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
Esf1Q3V1V3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.1
Esf1Q3V1V3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Esf1Q3V1V3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Esf1Q3V1V3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms