Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZP4

Svip, Small VCP/p97-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvipQ3UZP4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SvipQ3UZP4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SvipQ3UZP4 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
SvipQ3UZP4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SvipQ3UZP4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SvipQ3UZP4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.1 ms