Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cracr2aQ3UP38 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cracr2aQ3UP38 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cracr2aQ3UP38 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cracr2aQ3UP38 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cracr2aQ3UP38 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cracr2aQ3UP38 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cracr2aQ3UP38 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cracr2aQ3UP38 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cracr2aQ3UP38 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Cracr2aQ3UP38 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cracr2aQ3UP38 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Cracr2aQ3UP38 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Cracr2aQ3UP38 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cracr2aQ3UP38 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Cracr2aQ3UP38 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cracr2aQ3UP38 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cracr2aQ3UP38 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cracr2aQ3UP38 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cracr2aQ3UP38 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cracr2aQ3UP38 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cracr2aQ3UP38 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cracr2aQ3UP38 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cracr2aQ3UP38 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cracr2aQ3UP38 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Cracr2aQ3UP38 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cracr2aQ3UP38 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cracr2aQ3UP38 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cracr2aQ3UP38 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cracr2aQ3UP38 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Cracr2aQ3UP38 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cracr2aQ3UP38 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cracr2aQ3UP38 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cracr2aQ3UP38 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Cracr2aQ3UP38 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cracr2aQ3UP38 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cracr2aQ3UP38 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cracr2aQ3UP38 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cracr2aQ3UP38 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cracr2aQ3UP38 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cracr2aQ3UP38 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Cracr2aQ3UP38 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cracr2aQ3UP38 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cracr2aQ3UP38 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cracr2aQ3UP38 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cracr2aQ3UP38 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cracr2aQ3UP38 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cracr2aQ3UP38 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cracr2aQ3UP38 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cracr2aQ3UP38 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cracr2aQ3UP38 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cracr2aQ3UP38 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cracr2aQ3UP38 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cracr2aQ3UP38 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cracr2aQ3UP38 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cracr2aQ3UP38 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cracr2aQ3UP38 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cracr2aQ3UP38 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cracr2aQ3UP38 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cracr2aQ3UP38 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cracr2aQ3UP38 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cracr2aQ3UP38 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cracr2aQ3UP38 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cracr2aQ3UP38 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cracr2aQ3UP38 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cracr2aQ3UP38 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cracr2aQ3UP38 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cracr2aQ3UP38 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cracr2aQ3UP38 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cracr2aQ3UP38 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cracr2aQ3UP38 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cracr2aQ3UP38 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cracr2aQ3UP38 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cracr2aQ3UP38 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cracr2aQ3UP38 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cracr2aQ3UP38 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cracr2aQ3UP38 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cracr2aQ3UP38 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cracr2aQ3UP38 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms