Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26,41■■□□□ 1,82
Ccdc33Q3ULW6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,41■■□□□ 1,82
Ccdc33Q3ULW6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Ccdc33Q3ULW6 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,39■■□□□ 1,82
Ccdc33Q3ULW6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Ccdc33Q3ULW6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Ccdc33Q3ULW6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Ccdc33Q3ULW6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Ccdc33Q3ULW6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Ccdc33Q3ULW6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Ccdc33Q3ULW6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Ccdc33Q3ULW6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Ccdc33Q3ULW6 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Ccdc33Q3ULW6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26,34■■□□□ 1,81
Ccdc33Q3ULW6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Ccdc33Q3ULW6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,33■■□□□ 1,81
Ccdc33Q3ULW6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Ccdc33Q3ULW6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26,32■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26,32■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26,28■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26,27■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Ccdc33Q3ULW6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26,26■■□□□ 1,79
Ccdc33Q3ULW6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Ccdc33Q3ULW6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26,26■■□□□ 1,79
Ccdc33Q3ULW6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26,26■■□□□ 1,79
Ccdc33Q3ULW6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26,25■■□□□ 1,79
Ccdc33Q3ULW6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26,25■■□□□ 1,79
Ccdc33Q3ULW6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Ccdc33Q3ULW6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Ccdc33Q3ULW6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Ccdc33Q3ULW6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Ccdc33Q3ULW6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Ccdc33Q3ULW6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,24■■□□□ 1,79
Ccdc33Q3ULW6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Ccdc33Q3ULW6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Ccdc33Q3ULW6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26,24■■□□□ 1,79
Ccdc33Q3ULW6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Ccdc33Q3ULW6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Ccdc33Q3ULW6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Ccdc33Q3ULW6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26,21■■□□□ 1,79
Ccdc33Q3ULW6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,79
Ccdc33Q3ULW6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Ccdc33Q3ULW6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Ccdc33Q3ULW6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26,2■■□□□ 1,78
Ccdc33Q3ULW6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26,2■■□□□ 1,78
Ccdc33Q3ULW6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26,19■■□□□ 1,78
Ccdc33Q3ULW6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Ccdc33Q3ULW6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Ccdc33Q3ULW6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Ccdc33Q3ULW6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Ccdc33Q3ULW6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Ccdc33Q3ULW6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Ccdc33Q3ULW6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Ccdc33Q3ULW6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26,16■■□□□ 1,78
Ccdc33Q3ULW6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,15■■□□□ 1,78
Ccdc33Q3ULW6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Ccdc33Q3ULW6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Ccdc33Q3ULW6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,15■■□□□ 1,78
Ccdc33Q3ULW6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Ccdc33Q3ULW6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Ccdc33Q3ULW6 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Ccdc33Q3ULW6 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26,14■■□□□ 1,78
Ccdc33Q3ULW6 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Ccdc33Q3ULW6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Ccdc33Q3ULW6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,13■■□□□ 1,77
Ccdc33Q3ULW6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Ccdc33Q3ULW6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Ccdc33Q3ULW6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,11■■□□□ 1,77
Ccdc33Q3ULW6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Ccdc33Q3ULW6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26,1■■□□□ 1,77
Ccdc33Q3ULW6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26,1■■□□□ 1,77
Ccdc33Q3ULW6 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Ccdc33Q3ULW6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Ccdc33Q3ULW6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Ccdc33Q3ULW6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Ccdc33Q3ULW6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Ccdc33Q3ULW6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Ccdc33Q3ULW6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Ccdc33Q3ULW6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Ccdc33Q3ULW6 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Ccdc33Q3ULW6 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Ccdc33Q3ULW6 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17,5 ms