Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU4

Fam83f, Protein FAM83F, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam83fQ3UKU4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam83fQ3UKU4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam83fQ3UKU4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam83fQ3UKU4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam83fQ3UKU4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam83fQ3UKU4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam83fQ3UKU4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam83fQ3UKU4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam83fQ3UKU4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam83fQ3UKU4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam83fQ3UKU4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam83fQ3UKU4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam83fQ3UKU4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam83fQ3UKU4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam83fQ3UKU4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam83fQ3UKU4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam83fQ3UKU4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam83fQ3UKU4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam83fQ3UKU4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam83fQ3UKU4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam83fQ3UKU4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam83fQ3UKU4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam83fQ3UKU4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam83fQ3UKU4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam83fQ3UKU4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam83fQ3UKU4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam83fQ3UKU4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam83fQ3UKU4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Fam83fQ3UKU4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam83fQ3UKU4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam83fQ3UKU4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam83fQ3UKU4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam83fQ3UKU4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Fam83fQ3UKU4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam83fQ3UKU4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam83fQ3UKU4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam83fQ3UKU4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam83fQ3UKU4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam83fQ3UKU4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam83fQ3UKU4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam83fQ3UKU4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam83fQ3UKU4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam83fQ3UKU4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam83fQ3UKU4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam83fQ3UKU4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam83fQ3UKU4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam83fQ3UKU4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam83fQ3UKU4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam83fQ3UKU4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam83fQ3UKU4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam83fQ3UKU4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam83fQ3UKU4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83fQ3UKU4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83fQ3UKU4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83fQ3UKU4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83fQ3UKU4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83fQ3UKU4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam83fQ3UKU4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam83fQ3UKU4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam83fQ3UKU4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam83fQ3UKU4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam83fQ3UKU4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam83fQ3UKU4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam83fQ3UKU4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam83fQ3UKU4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam83fQ3UKU4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Fam83fQ3UKU4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83fQ3UKU4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Fam83fQ3UKU4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam83fQ3UKU4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Fam83fQ3UKU4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam83fQ3UKU4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Fam83fQ3UKU4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam83fQ3UKU4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam83fQ3UKU4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam83fQ3UKU4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam83fQ3UKU4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam83fQ3UKU4 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Fam83fQ3UKU4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Fam83fQ3UKU4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam83fQ3UKU4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Fam83fQ3UKU4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam83fQ3UKU4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Fam83fQ3UKU4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Fam83fQ3UKU4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam83fQ3UKU4 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Fam83fQ3UKU4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam83fQ3UKU4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Fam83fQ3UKU4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam83fQ3UKU4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Fam83fQ3UKU4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam83fQ3UKU4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Fam83fQ3UKU4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Fam83fQ3UKU4 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Fam83fQ3UKU4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 98.6 ms