Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Ceacam12Q3UKP4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ceacam12Q3UKP4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ceacam12Q3UKP4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Ceacam12Q3UKP4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Ceacam12Q3UKP4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ceacam12Q3UKP4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ceacam12Q3UKP4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Ceacam12Q3UKP4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ceacam12Q3UKP4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ceacam12Q3UKP4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Ceacam12Q3UKP4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ceacam12Q3UKP4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Ceacam12Q3UKP4 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Ceacam12Q3UKP4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Ceacam12Q3UKP4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ceacam12Q3UKP4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ceacam12Q3UKP4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ceacam12Q3UKP4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ceacam12Q3UKP4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ceacam12Q3UKP4 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ceacam12Q3UKP4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ceacam12Q3UKP4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ceacam12Q3UKP4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ceacam12Q3UKP4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ceacam12Q3UKP4 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ceacam12Q3UKP4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ceacam12Q3UKP4 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ceacam12Q3UKP4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ceacam12Q3UKP4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ceacam12Q3UKP4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ceacam12Q3UKP4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ceacam12Q3UKP4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ceacam12Q3UKP4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ceacam12Q3UKP4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ceacam12Q3UKP4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ceacam12Q3UKP4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ceacam12Q3UKP4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms