Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHA3

Spg11, Spatacsin, mousemouse

Predictions only

Length 2,430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spg11Q3UHA3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Spg11Q3UHA3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spg11Q3UHA3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Spg11Q3UHA3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spg11Q3UHA3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spg11Q3UHA3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spg11Q3UHA3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Spg11Q3UHA3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Spg11Q3UHA3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Spg11Q3UHA3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spg11Q3UHA3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Spg11Q3UHA3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spg11Q3UHA3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spg11Q3UHA3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Spg11Q3UHA3 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spg11Q3UHA3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Spg11Q3UHA3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spg11Q3UHA3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Spg11Q3UHA3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spg11Q3UHA3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spg11Q3UHA3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Spg11Q3UHA3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spg11Q3UHA3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spg11Q3UHA3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Spg11Q3UHA3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spg11Q3UHA3 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spg11Q3UHA3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Spg11Q3UHA3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spg11Q3UHA3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Spg11Q3UHA3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Spg11Q3UHA3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Spg11Q3UHA3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spg11Q3UHA3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spg11Q3UHA3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Spg11Q3UHA3 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spg11Q3UHA3 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spg11Q3UHA3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spg11Q3UHA3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spg11Q3UHA3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Spg11Q3UHA3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spg11Q3UHA3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Spg11Q3UHA3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spg11Q3UHA3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spg11Q3UHA3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Spg11Q3UHA3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Spg11Q3UHA3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Spg11Q3UHA3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spg11Q3UHA3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spg11Q3UHA3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Spg11Q3UHA3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Spg11Q3UHA3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Spg11Q3UHA3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spg11Q3UHA3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Spg11Q3UHA3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Spg11Q3UHA3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spg11Q3UHA3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spg11Q3UHA3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Spg11Q3UHA3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spg11Q3UHA3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spg11Q3UHA3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Spg11Q3UHA3 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spg11Q3UHA3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spg11Q3UHA3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spg11Q3UHA3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Spg11Q3UHA3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spg11Q3UHA3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spg11Q3UHA3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spg11Q3UHA3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Spg11Q3UHA3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spg11Q3UHA3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spg11Q3UHA3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Spg11Q3UHA3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Spg11Q3UHA3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spg11Q3UHA3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spg11Q3UHA3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spg11Q3UHA3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Spg11Q3UHA3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spg11Q3UHA3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spg11Q3UHA3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Spg11Q3UHA3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Spg11Q3UHA3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Spg11Q3UHA3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spg11Q3UHA3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spg11Q3UHA3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spg11Q3UHA3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spg11Q3UHA3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Spg11Q3UHA3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spg11Q3UHA3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spg11Q3UHA3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spg11Q3UHA3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Spg11Q3UHA3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spg11Q3UHA3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Spg11Q3UHA3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Spg11Q3UHA3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Spg11Q3UHA3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spg11Q3UHA3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Spg11Q3UHA3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spg11Q3UHA3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Spg11Q3UHA3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Spg11Q3UHA3 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms