Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Garem1Q3UFT3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Garem1Q3UFT3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Garem1Q3UFT3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Garem1Q3UFT3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Garem1Q3UFT3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Garem1Q3UFT3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Garem1Q3UFT3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Garem1Q3UFT3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Garem1Q3UFT3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Garem1Q3UFT3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Garem1Q3UFT3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Garem1Q3UFT3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Garem1Q3UFT3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Garem1Q3UFT3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Garem1Q3UFT3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Garem1Q3UFT3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Garem1Q3UFT3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Garem1Q3UFT3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Garem1Q3UFT3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Garem1Q3UFT3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Garem1Q3UFT3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Garem1Q3UFT3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Garem1Q3UFT3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Garem1Q3UFT3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Garem1Q3UFT3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Garem1Q3UFT3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Garem1Q3UFT3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Garem1Q3UFT3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Garem1Q3UFT3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Garem1Q3UFT3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Garem1Q3UFT3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Garem1Q3UFT3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Garem1Q3UFT3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Garem1Q3UFT3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Garem1Q3UFT3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Garem1Q3UFT3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Garem1Q3UFT3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Garem1Q3UFT3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Garem1Q3UFT3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Garem1Q3UFT3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Garem1Q3UFT3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Garem1Q3UFT3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Garem1Q3UFT3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Garem1Q3UFT3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Garem1Q3UFT3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Garem1Q3UFT3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Garem1Q3UFT3 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Garem1Q3UFT3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Garem1Q3UFT3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Garem1Q3UFT3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms