Protein–RNA interactions for Protein: Q3UF64

Rnft2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft2Q3UF64 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rnft2Q3UF64 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnft2Q3UF64 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnft2Q3UF64 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Rnft2Q3UF64 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms