Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cops9Q3U898 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cops9Q3U898 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cops9Q3U898 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cops9Q3U898 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cops9Q3U898 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms