Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1D0

Lins1, Protein Lines homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lins1Q3U1D0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lins1Q3U1D0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lins1Q3U1D0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lins1Q3U1D0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lins1Q3U1D0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lins1Q3U1D0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lins1Q3U1D0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Lins1Q3U1D0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lins1Q3U1D0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lins1Q3U1D0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lins1Q3U1D0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lins1Q3U1D0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lins1Q3U1D0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lins1Q3U1D0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lins1Q3U1D0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lins1Q3U1D0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lins1Q3U1D0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lins1Q3U1D0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lins1Q3U1D0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lins1Q3U1D0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lins1Q3U1D0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lins1Q3U1D0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Lins1Q3U1D0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lins1Q3U1D0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lins1Q3U1D0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lins1Q3U1D0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lins1Q3U1D0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lins1Q3U1D0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lins1Q3U1D0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lins1Q3U1D0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lins1Q3U1D0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lins1Q3U1D0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lins1Q3U1D0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lins1Q3U1D0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lins1Q3U1D0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lins1Q3U1D0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lins1Q3U1D0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lins1Q3U1D0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lins1Q3U1D0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lins1Q3U1D0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lins1Q3U1D0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lins1Q3U1D0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lins1Q3U1D0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lins1Q3U1D0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lins1Q3U1D0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lins1Q3U1D0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lins1Q3U1D0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lins1Q3U1D0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lins1Q3U1D0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lins1Q3U1D0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Lins1Q3U1D0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lins1Q3U1D0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lins1Q3U1D0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lins1Q3U1D0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lins1Q3U1D0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lins1Q3U1D0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lins1Q3U1D0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lins1Q3U1D0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lins1Q3U1D0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lins1Q3U1D0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lins1Q3U1D0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lins1Q3U1D0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lins1Q3U1D0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lins1Q3U1D0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lins1Q3U1D0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lins1Q3U1D0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lins1Q3U1D0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lins1Q3U1D0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lins1Q3U1D0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Lins1Q3U1D0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lins1Q3U1D0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lins1Q3U1D0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lins1Q3U1D0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lins1Q3U1D0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lins1Q3U1D0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lins1Q3U1D0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lins1Q3U1D0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lins1Q3U1D0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lins1Q3U1D0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lins1Q3U1D0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Lins1Q3U1D0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lins1Q3U1D0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lins1Q3U1D0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lins1Q3U1D0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lins1Q3U1D0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lins1Q3U1D0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lins1Q3U1D0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lins1Q3U1D0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lins1Q3U1D0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lins1Q3U1D0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lins1Q3U1D0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lins1Q3U1D0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lins1Q3U1D0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Lins1Q3U1D0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lins1Q3U1D0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lins1Q3U1D0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Lins1Q3U1D0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lins1Q3U1D0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Lins1Q3U1D0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Lins1Q3U1D0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms