Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkl4Q3TZA2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdkl4Q3TZA2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdkl4Q3TZA2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdkl4Q3TZA2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkl4Q3TZA2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkl4Q3TZA2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkl4Q3TZA2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdkl4Q3TZA2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkl4Q3TZA2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkl4Q3TZA2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdkl4Q3TZA2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkl4Q3TZA2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkl4Q3TZA2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkl4Q3TZA2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkl4Q3TZA2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkl4Q3TZA2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdkl4Q3TZA2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkl4Q3TZA2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdkl4Q3TZA2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkl4Q3TZA2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkl4Q3TZA2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkl4Q3TZA2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdkl4Q3TZA2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkl4Q3TZA2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkl4Q3TZA2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkl4Q3TZA2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkl4Q3TZA2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdkl4Q3TZA2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkl4Q3TZA2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkl4Q3TZA2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdkl4Q3TZA2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdkl4Q3TZA2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdkl4Q3TZA2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkl4Q3TZA2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdkl4Q3TZA2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdkl4Q3TZA2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cdkl4Q3TZA2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdkl4Q3TZA2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdkl4Q3TZA2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Cdkl4Q3TZA2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkl4Q3TZA2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkl4Q3TZA2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cdkl4Q3TZA2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkl4Q3TZA2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkl4Q3TZA2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cdkl4Q3TZA2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkl4Q3TZA2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkl4Q3TZA2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkl4Q3TZA2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkl4Q3TZA2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cdkl4Q3TZA2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cdkl4Q3TZA2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkl4Q3TZA2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkl4Q3TZA2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkl4Q3TZA2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cdkl4Q3TZA2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkl4Q3TZA2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkl4Q3TZA2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cdkl4Q3TZA2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdkl4Q3TZA2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdkl4Q3TZA2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cdkl4Q3TZA2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdkl4Q3TZA2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdkl4Q3TZA2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cdkl4Q3TZA2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdkl4Q3TZA2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cdkl4Q3TZA2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkl4Q3TZA2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cdkl4Q3TZA2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkl4Q3TZA2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cdkl4Q3TZA2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkl4Q3TZA2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkl4Q3TZA2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cdkl4Q3TZA2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cdkl4Q3TZA2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cdkl4Q3TZA2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cdkl4Q3TZA2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdkl4Q3TZA2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdkl4Q3TZA2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cdkl4Q3TZA2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkl4Q3TZA2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkl4Q3TZA2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cdkl4Q3TZA2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkl4Q3TZA2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkl4Q3TZA2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkl4Q3TZA2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkl4Q3TZA2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cdkl4Q3TZA2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cdkl4Q3TZA2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cdkl4Q3TZA2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkl4Q3TZA2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkl4Q3TZA2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cdkl4Q3TZA2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdkl4Q3TZA2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cdkl4Q3TZA2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cdkl4Q3TZA2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkl4Q3TZA2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkl4Q3TZA2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cdkl4Q3TZA2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms