Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC93

Hs1bp3, HCLS1-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs1bp3Q3TC93 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Hs1bp3Q3TC93 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Hs1bp3Q3TC93 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hs1bp3Q3TC93 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Hs1bp3Q3TC93 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hs1bp3Q3TC93 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hs1bp3Q3TC93 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Hs1bp3Q3TC93 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hs1bp3Q3TC93 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hs1bp3Q3TC93 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hs1bp3Q3TC93 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hs1bp3Q3TC93 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Hs1bp3Q3TC93 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Hs1bp3Q3TC93 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hs1bp3Q3TC93 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hs1bp3Q3TC93 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hs1bp3Q3TC93 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Hs1bp3Q3TC93 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hs1bp3Q3TC93 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hs1bp3Q3TC93 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hs1bp3Q3TC93 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hs1bp3Q3TC93 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hs1bp3Q3TC93 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Hs1bp3Q3TC93 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Hs1bp3Q3TC93 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hs1bp3Q3TC93 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hs1bp3Q3TC93 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hs1bp3Q3TC93 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hs1bp3Q3TC93 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Hs1bp3Q3TC93 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hs1bp3Q3TC93 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hs1bp3Q3TC93 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Hs1bp3Q3TC93 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Hs1bp3Q3TC93 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hs1bp3Q3TC93 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hs1bp3Q3TC93 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hs1bp3Q3TC93 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hs1bp3Q3TC93 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Hs1bp3Q3TC93 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Hs1bp3Q3TC93 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Hs1bp3Q3TC93 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Hs1bp3Q3TC93 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Hs1bp3Q3TC93 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hs1bp3Q3TC93 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Hs1bp3Q3TC93 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Hs1bp3Q3TC93 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hs1bp3Q3TC93 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Hs1bp3Q3TC93 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Hs1bp3Q3TC93 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Hs1bp3Q3TC93 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Hs1bp3Q3TC93 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hs1bp3Q3TC93 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hs1bp3Q3TC93 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Hs1bp3Q3TC93 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hs1bp3Q3TC93 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hs1bp3Q3TC93 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Hs1bp3Q3TC93 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Hs1bp3Q3TC93 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hs1bp3Q3TC93 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Hs1bp3Q3TC93 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hs1bp3Q3TC93 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hs1bp3Q3TC93 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hs1bp3Q3TC93 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Hs1bp3Q3TC93 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hs1bp3Q3TC93 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hs1bp3Q3TC93 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hs1bp3Q3TC93 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hs1bp3Q3TC93 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Hs1bp3Q3TC93 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hs1bp3Q3TC93 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Hs1bp3Q3TC93 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hs1bp3Q3TC93 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hs1bp3Q3TC93 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Hs1bp3Q3TC93 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Hs1bp3Q3TC93 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hs1bp3Q3TC93 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hs1bp3Q3TC93 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Hs1bp3Q3TC93 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Hs1bp3Q3TC93 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hs1bp3Q3TC93 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Hs1bp3Q3TC93 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hs1bp3Q3TC93 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hs1bp3Q3TC93 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hs1bp3Q3TC93 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hs1bp3Q3TC93 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Hs1bp3Q3TC93 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Hs1bp3Q3TC93 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hs1bp3Q3TC93 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Hs1bp3Q3TC93 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hs1bp3Q3TC93 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hs1bp3Q3TC93 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Hs1bp3Q3TC93 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hs1bp3Q3TC93 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hs1bp3Q3TC93 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hs1bp3Q3TC93 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hs1bp3Q3TC93 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Hs1bp3Q3TC93 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hs1bp3Q3TC93 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hs1bp3Q3TC93 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Hs1bp3Q3TC93 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms