Protein–RNA interactions for Protein: Q3LAC4

Prex2, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate-dependent Rac exchanger 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prex2Q3LAC4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Prex2Q3LAC4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Prex2Q3LAC4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Prex2Q3LAC4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC36.6■■■■□ 3.45
Prex2Q3LAC4 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Prex2Q3LAC4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
Prex2Q3LAC4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC36.57■■■■□ 3.45
Prex2Q3LAC4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
Prex2Q3LAC4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
Prex2Q3LAC4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Prex2Q3LAC4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Prex2Q3LAC4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Prex2Q3LAC4 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Prex2Q3LAC4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Prex2Q3LAC4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
Prex2Q3LAC4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Prex2Q3LAC4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
Prex2Q3LAC4 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Prex2Q3LAC4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Prex2Q3LAC4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
Prex2Q3LAC4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
Prex2Q3LAC4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Prex2Q3LAC4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Prex2Q3LAC4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.48■■■■□ 3.43
Prex2Q3LAC4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
Prex2Q3LAC4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Prex2Q3LAC4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Prex2Q3LAC4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
Prex2Q3LAC4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Prex2Q3LAC4 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
Prex2Q3LAC4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Prex2Q3LAC4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Prex2Q3LAC4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Prex2Q3LAC4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
Prex2Q3LAC4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Prex2Q3LAC4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Prex2Q3LAC4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Prex2Q3LAC4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Prex2Q3LAC4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Prex2Q3LAC4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Prex2Q3LAC4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Prex2Q3LAC4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Prex2Q3LAC4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
Prex2Q3LAC4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Prex2Q3LAC4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Prex2Q3LAC4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Prex2Q3LAC4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
Prex2Q3LAC4 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Prex2Q3LAC4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Prex2Q3LAC4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Prex2Q3LAC4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Prex2Q3LAC4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
Prex2Q3LAC4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Prex2Q3LAC4 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Prex2Q3LAC4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Prex2Q3LAC4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Prex2Q3LAC4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Prex2Q3LAC4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Prex2Q3LAC4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Prex2Q3LAC4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Prex2Q3LAC4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Prex2Q3LAC4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Prex2Q3LAC4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Prex2Q3LAC4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Prex2Q3LAC4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Prex2Q3LAC4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Prex2Q3LAC4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Prex2Q3LAC4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Prex2Q3LAC4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Prex2Q3LAC4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
Prex2Q3LAC4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Prex2Q3LAC4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Prex2Q3LAC4 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Prex2Q3LAC4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
Prex2Q3LAC4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Prex2Q3LAC4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Prex2Q3LAC4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Prex2Q3LAC4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Prex2Q3LAC4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
Prex2Q3LAC4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Prex2Q3LAC4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
Prex2Q3LAC4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Prex2Q3LAC4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
Prex2Q3LAC4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Prex2Q3LAC4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Prex2Q3LAC4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Prex2Q3LAC4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
Prex2Q3LAC4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Prex2Q3LAC4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Prex2Q3LAC4 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Prex2Q3LAC4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Prex2Q3LAC4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Prex2Q3LAC4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Prex2Q3LAC4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Prex2Q3LAC4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Prex2Q3LAC4 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Prex2Q3LAC4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Prex2Q3LAC4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Prex2Q3LAC4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Prex2Q3LAC4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms