Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms