Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Trim71Q1PSW8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Trim71Q1PSW8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trim71Q1PSW8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Trim71Q1PSW8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Trim71Q1PSW8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trim71Q1PSW8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trim71Q1PSW8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
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