Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cers3Q1A3B0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Cers3Q1A3B0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cers3Q1A3B0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cers3Q1A3B0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Cers3Q1A3B0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
Cers3Q1A3B0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cers3Q1A3B0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Cers3Q1A3B0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cers3Q1A3B0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cers3Q1A3B0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cers3Q1A3B0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cers3Q1A3B0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cers3Q1A3B0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Cers3Q1A3B0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
Cers3Q1A3B0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Cers3Q1A3B0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Cers3Q1A3B0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cers3Q1A3B0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cers3Q1A3B0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Cers3Q1A3B0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Cers3Q1A3B0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cers3Q1A3B0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Cers3Q1A3B0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cers3Q1A3B0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cers3Q1A3B0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Cers3Q1A3B0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Cers3Q1A3B0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cers3Q1A3B0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cers3Q1A3B0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cers3Q1A3B0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cers3Q1A3B0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Cers3Q1A3B0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cers3Q1A3B0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cers3Q1A3B0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Cers3Q1A3B0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Cers3Q1A3B0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cers3Q1A3B0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cers3Q1A3B0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cers3Q1A3B0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Cers3Q1A3B0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Cers3Q1A3B0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Cers3Q1A3B0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cers3Q1A3B0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Cers3Q1A3B0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cers3Q1A3B0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cers3Q1A3B0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Cers3Q1A3B0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cers3Q1A3B0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Cers3Q1A3B0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cers3Q1A3B0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cers3Q1A3B0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Cers3Q1A3B0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Cers3Q1A3B0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Cers3Q1A3B0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Cers3Q1A3B0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cers3Q1A3B0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Cers3Q1A3B0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Cers3Q1A3B0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Cers3Q1A3B0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Cers3Q1A3B0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Cers3Q1A3B0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Cers3Q1A3B0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Cers3Q1A3B0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
Cers3Q1A3B0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cers3Q1A3B0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Cers3Q1A3B0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cers3Q1A3B0 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cers3Q1A3B0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cers3Q1A3B0 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cers3Q1A3B0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cers3Q1A3B0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Cers3Q1A3B0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cers3Q1A3B0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Cers3Q1A3B0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cers3Q1A3B0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cers3Q1A3B0 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cers3Q1A3B0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cers3Q1A3B0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Cers3Q1A3B0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cers3Q1A3B0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cers3Q1A3B0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Cers3Q1A3B0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cers3Q1A3B0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Cers3Q1A3B0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Cers3Q1A3B0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cers3Q1A3B0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Cers3Q1A3B0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Cers3Q1A3B0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
Cers3Q1A3B0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cers3Q1A3B0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Cers3Q1A3B0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Cers3Q1A3B0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cers3Q1A3B0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Cers3Q1A3B0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Cers3Q1A3B0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Cers3Q1A3B0 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cers3Q1A3B0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Cers3Q1A3B0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Cers3Q1A3B0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
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