Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF94

Nkpd1, NTPase KAP family P-loop domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkpd1Q0VF94 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkpd1Q0VF94 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkpd1Q0VF94 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkpd1Q0VF94 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkpd1Q0VF94 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nkpd1Q0VF94 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nkpd1Q0VF94 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkpd1Q0VF94 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkpd1Q0VF94 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkpd1Q0VF94 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkpd1Q0VF94 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkpd1Q0VF94 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkpd1Q0VF94 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkpd1Q0VF94 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Nkpd1Q0VF94 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkpd1Q0VF94 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Nkpd1Q0VF94 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Nkpd1Q0VF94 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Nkpd1Q0VF94 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkpd1Q0VF94 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkpd1Q0VF94 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkpd1Q0VF94 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Nkpd1Q0VF94 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkpd1Q0VF94 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkpd1Q0VF94 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkpd1Q0VF94 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Nkpd1Q0VF94 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Nkpd1Q0VF94 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkpd1Q0VF94 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Nkpd1Q0VF94 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkpd1Q0VF94 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkpd1Q0VF94 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Nkpd1Q0VF94 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkpd1Q0VF94 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkpd1Q0VF94 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkpd1Q0VF94 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkpd1Q0VF94 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkpd1Q0VF94 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Nkpd1Q0VF94 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nkpd1Q0VF94 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Nkpd1Q0VF94 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkpd1Q0VF94 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkpd1Q0VF94 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkpd1Q0VF94 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkpd1Q0VF94 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Nkpd1Q0VF94 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkpd1Q0VF94 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkpd1Q0VF94 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Nkpd1Q0VF94 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkpd1Q0VF94 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkpd1Q0VF94 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkpd1Q0VF94 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Nkpd1Q0VF94 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkpd1Q0VF94 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkpd1Q0VF94 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nkpd1Q0VF94 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nkpd1Q0VF94 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nkpd1Q0VF94 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkpd1Q0VF94 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nkpd1Q0VF94 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkpd1Q0VF94 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nkpd1Q0VF94 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkpd1Q0VF94 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkpd1Q0VF94 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkpd1Q0VF94 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkpd1Q0VF94 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nkpd1Q0VF94 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkpd1Q0VF94 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkpd1Q0VF94 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkpd1Q0VF94 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nkpd1Q0VF94 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkpd1Q0VF94 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkpd1Q0VF94 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkpd1Q0VF94 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nkpd1Q0VF94 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkpd1Q0VF94 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Nkpd1Q0VF94 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms