Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Vps8Q0P5W1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Vps8Q0P5W1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Vps8Q0P5W1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Vps8Q0P5W1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Vps8Q0P5W1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Vps8Q0P5W1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Vps8Q0P5W1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Vps8Q0P5W1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Vps8Q0P5W1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Vps8Q0P5W1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Vps8Q0P5W1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Vps8Q0P5W1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Vps8Q0P5W1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Vps8Q0P5W1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Vps8Q0P5W1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Vps8Q0P5W1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Vps8Q0P5W1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Vps8Q0P5W1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Vps8Q0P5W1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Vps8Q0P5W1 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Vps8Q0P5W1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Vps8Q0P5W1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Vps8Q0P5W1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
Vps8Q0P5W1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Vps8Q0P5W1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Vps8Q0P5W1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Vps8Q0P5W1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Vps8Q0P5W1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
Vps8Q0P5W1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Vps8Q0P5W1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Vps8Q0P5W1 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Vps8Q0P5W1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Vps8Q0P5W1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Vps8Q0P5W1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Vps8Q0P5W1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC35.31■■■■□ 3.24
Vps8Q0P5W1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Vps8Q0P5W1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Vps8Q0P5W1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Vps8Q0P5W1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Vps8Q0P5W1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Vps8Q0P5W1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Vps8Q0P5W1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Vps8Q0P5W1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Vps8Q0P5W1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Vps8Q0P5W1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Vps8Q0P5W1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Vps8Q0P5W1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Vps8Q0P5W1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Vps8Q0P5W1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Vps8Q0P5W1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Vps8Q0P5W1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Vps8Q0P5W1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Vps8Q0P5W1 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Vps8Q0P5W1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Vps8Q0P5W1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Vps8Q0P5W1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
Vps8Q0P5W1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Vps8Q0P5W1 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Vps8Q0P5W1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Vps8Q0P5W1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Vps8Q0P5W1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Vps8Q0P5W1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Vps8Q0P5W1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Vps8Q0P5W1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Vps8Q0P5W1 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Vps8Q0P5W1 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Vps8Q0P5W1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Vps8Q0P5W1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Vps8Q0P5W1 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Vps8Q0P5W1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Vps8Q0P5W1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Vps8Q0P5W1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Vps8Q0P5W1 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Vps8Q0P5W1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Vps8Q0P5W1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Vps8Q0P5W1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Vps8Q0P5W1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Vps8Q0P5W1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Vps8Q0P5W1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Vps8Q0P5W1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Vps8Q0P5W1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Vps8Q0P5W1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Vps8Q0P5W1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Vps8Q0P5W1 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.95■■■■□ 3.19
Vps8Q0P5W1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Vps8Q0P5W1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Vps8Q0P5W1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Vps8Q0P5W1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Vps8Q0P5W1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Vps8Q0P5W1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Vps8Q0P5W1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Vps8Q0P5W1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Vps8Q0P5W1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Vps8Q0P5W1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.9■■■■□ 3.18
Vps8Q0P5W1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Vps8Q0P5W1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Vps8Q0P5W1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Vps8Q0P5W1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Vps8Q0P5W1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms