Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5V2

Sobp, Sine oculis-binding protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 864 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SobpQ0P5V2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SobpQ0P5V2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SobpQ0P5V2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SobpQ0P5V2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SobpQ0P5V2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SobpQ0P5V2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SobpQ0P5V2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SobpQ0P5V2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SobpQ0P5V2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SobpQ0P5V2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SobpQ0P5V2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SobpQ0P5V2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SobpQ0P5V2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SobpQ0P5V2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SobpQ0P5V2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SobpQ0P5V2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SobpQ0P5V2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SobpQ0P5V2 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SobpQ0P5V2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
SobpQ0P5V2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SobpQ0P5V2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SobpQ0P5V2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SobpQ0P5V2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SobpQ0P5V2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SobpQ0P5V2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SobpQ0P5V2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SobpQ0P5V2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SobpQ0P5V2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SobpQ0P5V2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SobpQ0P5V2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SobpQ0P5V2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SobpQ0P5V2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SobpQ0P5V2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SobpQ0P5V2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SobpQ0P5V2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SobpQ0P5V2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SobpQ0P5V2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SobpQ0P5V2 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SobpQ0P5V2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SobpQ0P5V2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SobpQ0P5V2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SobpQ0P5V2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SobpQ0P5V2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SobpQ0P5V2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SobpQ0P5V2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SobpQ0P5V2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SobpQ0P5V2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SobpQ0P5V2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
SobpQ0P5V2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SobpQ0P5V2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SobpQ0P5V2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
SobpQ0P5V2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SobpQ0P5V2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SobpQ0P5V2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SobpQ0P5V2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SobpQ0P5V2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SobpQ0P5V2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SobpQ0P5V2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SobpQ0P5V2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SobpQ0P5V2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SobpQ0P5V2 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SobpQ0P5V2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SobpQ0P5V2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SobpQ0P5V2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SobpQ0P5V2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SobpQ0P5V2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SobpQ0P5V2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SobpQ0P5V2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SobpQ0P5V2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SobpQ0P5V2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SobpQ0P5V2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SobpQ0P5V2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SobpQ0P5V2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SobpQ0P5V2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SobpQ0P5V2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SobpQ0P5V2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SobpQ0P5V2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SobpQ0P5V2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SobpQ0P5V2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SobpQ0P5V2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SobpQ0P5V2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SobpQ0P5V2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SobpQ0P5V2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SobpQ0P5V2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SobpQ0P5V2 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SobpQ0P5V2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SobpQ0P5V2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SobpQ0P5V2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SobpQ0P5V2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SobpQ0P5V2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SobpQ0P5V2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SobpQ0P5V2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SobpQ0P5V2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SobpQ0P5V2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SobpQ0P5V2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SobpQ0P5V2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SobpQ0P5V2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SobpQ0P5V2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SobpQ0P5V2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SobpQ0P5V2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.1 ms