Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ubxn2bQ0KL01 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ubxn2bQ0KL01 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ubxn2bQ0KL01 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ubxn2bQ0KL01 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ubxn2bQ0KL01 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Ubxn2bQ0KL01 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ubxn2bQ0KL01 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ubxn2bQ0KL01 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ubxn2bQ0KL01 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Ubxn2bQ0KL01 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Ubxn2bQ0KL01 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ubxn2bQ0KL01 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ubxn2bQ0KL01 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Ubxn2bQ0KL01 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ubxn2bQ0KL01 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Ubxn2bQ0KL01 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ubxn2bQ0KL01 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ubxn2bQ0KL01 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ubxn2bQ0KL01 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ubxn2bQ0KL01 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ubxn2bQ0KL01 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ubxn2bQ0KL01 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ubxn2bQ0KL01 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ubxn2bQ0KL01 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ubxn2bQ0KL01 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Ubxn2bQ0KL01 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ubxn2bQ0KL01 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ubxn2bQ0KL01 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ubxn2bQ0KL01 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ubxn2bQ0KL01 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ubxn2bQ0KL01 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ubxn2bQ0KL01 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Ubxn2bQ0KL01 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Ubxn2bQ0KL01 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ubxn2bQ0KL01 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ubxn2bQ0KL01 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ubxn2bQ0KL01 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ubxn2bQ0KL01 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ubxn2bQ0KL01 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ubxn2bQ0KL01 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ubxn2bQ0KL01 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Ubxn2bQ0KL01 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ubxn2bQ0KL01 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ubxn2bQ0KL01 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ubxn2bQ0KL01 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Ubxn2bQ0KL01 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ubxn2bQ0KL01 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ubxn2bQ0KL01 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Ubxn2bQ0KL01 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ubxn2bQ0KL01 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Ubxn2bQ0KL01 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Ubxn2bQ0KL01 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ubxn2bQ0KL01 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ubxn2bQ0KL01 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Ubxn2bQ0KL01 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ubxn2bQ0KL01 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Ubxn2bQ0KL01 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ubxn2bQ0KL01 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Ubxn2bQ0KL01 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ubxn2bQ0KL01 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ubxn2bQ0KL01 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ubxn2bQ0KL01 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ubxn2bQ0KL01 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ubxn2bQ0KL01 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Ubxn2bQ0KL01 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ubxn2bQ0KL01 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ubxn2bQ0KL01 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ubxn2bQ0KL01 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ubxn2bQ0KL01 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Ubxn2bQ0KL01 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ubxn2bQ0KL01 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ubxn2bQ0KL01 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Ubxn2bQ0KL01 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ubxn2bQ0KL01 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ubxn2bQ0KL01 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ubxn2bQ0KL01 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ubxn2bQ0KL01 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ubxn2bQ0KL01 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Ubxn2bQ0KL01 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ubxn2bQ0KL01 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ubxn2bQ0KL01 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ubxn2bQ0KL01 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ubxn2bQ0KL01 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
Ubxn2bQ0KL01 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ubxn2bQ0KL01 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ubxn2bQ0KL01 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ubxn2bQ0KL01 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ubxn2bQ0KL01 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ubxn2bQ0KL01 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ubxn2bQ0KL01 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms