Protein–RNA interactions for Protein: Q08874

Mitf, Microphthalmia-associated transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MitfQ08874 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MitfQ08874 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MitfQ08874 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MitfQ08874 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MitfQ08874 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MitfQ08874 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MitfQ08874 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MitfQ08874 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MitfQ08874 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MitfQ08874 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MitfQ08874 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MitfQ08874 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
MitfQ08874 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MitfQ08874 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MitfQ08874 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MitfQ08874 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
MitfQ08874 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MitfQ08874 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
MitfQ08874 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MitfQ08874 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MitfQ08874 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MitfQ08874 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MitfQ08874 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MitfQ08874 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MitfQ08874 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MitfQ08874 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MitfQ08874 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MitfQ08874 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MitfQ08874 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MitfQ08874 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MitfQ08874 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MitfQ08874 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MitfQ08874 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MitfQ08874 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MitfQ08874 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MitfQ08874 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MitfQ08874 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MitfQ08874 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MitfQ08874 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MitfQ08874 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
MitfQ08874 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MitfQ08874 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
MitfQ08874 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MitfQ08874 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MitfQ08874 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MitfQ08874 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MitfQ08874 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms