Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tff2Q03404 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tff2Q03404 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Tff2Q03404 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tff2Q03404 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tff2Q03404 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tff2Q03404 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tff2Q03404 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tff2Q03404 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Tff2Q03404 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tff2Q03404 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tff2Q03404 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tff2Q03404 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tff2Q03404 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tff2Q03404 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Tff2Q03404 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tff2Q03404 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tff2Q03404 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tff2Q03404 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tff2Q03404 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tff2Q03404 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Tff2Q03404 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tff2Q03404 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tff2Q03404 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tff2Q03404 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tff2Q03404 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Tff2Q03404 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Tff2Q03404 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Tff2Q03404 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tff2Q03404 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tff2Q03404 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Tff2Q03404 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tff2Q03404 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tff2Q03404 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tff2Q03404 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tff2Q03404 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tff2Q03404 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tff2Q03404 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tff2Q03404 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tff2Q03404 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tff2Q03404 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tff2Q03404 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Tff2Q03404 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tff2Q03404 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tff2Q03404 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tff2Q03404 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Tff2Q03404 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tff2Q03404 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tff2Q03404 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Tff2Q03404 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tff2Q03404 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tff2Q03404 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Tff2Q03404 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms