Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms