Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ascl1Q02067 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ascl1Q02067 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ascl1Q02067 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ascl1Q02067 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ascl1Q02067 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms