Protein–RNA interactions for Protein: Q00342

Flt3, Receptor-type tyrosine-protein kinase FLT3, mousemouse

Predictions only

Length 1,000 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Flt3Q00342 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Flt3Q00342 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Flt3Q00342 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Flt3Q00342 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Flt3Q00342 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Flt3Q00342 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Flt3Q00342 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Flt3Q00342 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Flt3Q00342 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Flt3Q00342 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Flt3Q00342 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Flt3Q00342 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Flt3Q00342 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Flt3Q00342 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Flt3Q00342 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Flt3Q00342 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Flt3Q00342 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Flt3Q00342 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Flt3Q00342 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Flt3Q00342 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Flt3Q00342 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Flt3Q00342 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Flt3Q00342 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Flt3Q00342 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Flt3Q00342 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Flt3Q00342 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Flt3Q00342 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Flt3Q00342 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Flt3Q00342 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Flt3Q00342 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Flt3Q00342 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Flt3Q00342 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Flt3Q00342 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Flt3Q00342 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Flt3Q00342 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Flt3Q00342 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Flt3Q00342 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Flt3Q00342 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Flt3Q00342 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Flt3Q00342 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Flt3Q00342 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Flt3Q00342 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Flt3Q00342 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Flt3Q00342 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Flt3Q00342 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Flt3Q00342 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Flt3Q00342 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Flt3Q00342 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Flt3Q00342 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Flt3Q00342 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Flt3Q00342 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Flt3Q00342 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Flt3Q00342 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Flt3Q00342 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Flt3Q00342 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Flt3Q00342 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Flt3Q00342 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Flt3Q00342 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Flt3Q00342 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Flt3Q00342 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Flt3Q00342 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Flt3Q00342 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Flt3Q00342 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Flt3Q00342 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Flt3Q00342 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Flt3Q00342 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Flt3Q00342 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Flt3Q00342 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Flt3Q00342 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Flt3Q00342 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Flt3Q00342 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Flt3Q00342 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Flt3Q00342 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Flt3Q00342 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Flt3Q00342 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Flt3Q00342 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms