Protein–RNA interactions for Protein: Q00175

Pgr, Progesterone receptor, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgrQ00175 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PgrQ00175 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PgrQ00175 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PgrQ00175 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PgrQ00175 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PgrQ00175 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PgrQ00175 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PgrQ00175 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PgrQ00175 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PgrQ00175 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PgrQ00175 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PgrQ00175 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PgrQ00175 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PgrQ00175 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PgrQ00175 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PgrQ00175 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PgrQ00175 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PgrQ00175 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PgrQ00175 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PgrQ00175 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PgrQ00175 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PgrQ00175 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PgrQ00175 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PgrQ00175 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PgrQ00175 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PgrQ00175 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PgrQ00175 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PgrQ00175 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PgrQ00175 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PgrQ00175 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PgrQ00175 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PgrQ00175 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PgrQ00175 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PgrQ00175 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PgrQ00175 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PgrQ00175 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PgrQ00175 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PgrQ00175 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PgrQ00175 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PgrQ00175 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PgrQ00175 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PgrQ00175 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PgrQ00175 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PgrQ00175 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PgrQ00175 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PgrQ00175 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PgrQ00175 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PgrQ00175 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PgrQ00175 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PgrQ00175 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PgrQ00175 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PgrQ00175 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PgrQ00175 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PgrQ00175 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PgrQ00175 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PgrQ00175 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PgrQ00175 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PgrQ00175 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PgrQ00175 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PgrQ00175 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PgrQ00175 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PgrQ00175 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PgrQ00175 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PgrQ00175 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PgrQ00175 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PgrQ00175 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PgrQ00175 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PgrQ00175 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PgrQ00175 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PgrQ00175 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PgrQ00175 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PgrQ00175 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PgrQ00175 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms