Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp10Q000W5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp10Q000W5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp10Q000W5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gbp10Q000W5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp10Q000W5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp10Q000W5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gbp10Q000W5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp10Q000W5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gbp10Q000W5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp10Q000W5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp10Q000W5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gbp10Q000W5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gbp10Q000W5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gbp10Q000W5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gbp10Q000W5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gbp10Q000W5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp10Q000W5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp10Q000W5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gbp10Q000W5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp10Q000W5 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp10Q000W5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp10Q000W5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp10Q000W5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gbp10Q000W5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp10Q000W5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp10Q000W5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp10Q000W5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp10Q000W5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gbp10Q000W5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gbp10Q000W5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gbp10Q000W5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gbp10Q000W5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms