Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps45P97390 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps45P97390 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps45P97390 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Vps45P97390 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps45P97390 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps45P97390 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps45P97390 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Vps45P97390 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps45P97390 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps45P97390 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps45P97390 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Vps45P97390 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps45P97390 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps45P97390 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Vps45P97390 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Vps45P97390 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps45P97390 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Vps45P97390 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps45P97390 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps45P97390 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps45P97390 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps45P97390 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps45P97390 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Vps45P97390 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps45P97390 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps45P97390 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Vps45P97390 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps45P97390 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vps45P97390 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps45P97390 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps45P97390 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps45P97390 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Vps45P97390 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps45P97390 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps45P97390 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vps45P97390 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps45P97390 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps45P97390 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vps45P97390 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps45P97390 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps45P97390 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps45P97390 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps45P97390 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps45P97390 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vps45P97390 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps45P97390 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vps45P97390 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps45P97390 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps45P97390 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps45P97390 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vps45P97390 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps45P97390 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps45P97390 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps45P97390 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vps45P97390 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps45P97390 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps45P97390 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vps45P97390 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps45P97390 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps45P97390 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps45P97390 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps45P97390 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps45P97390 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps45P97390 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps45P97390 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps45P97390 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps45P97390 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps45P97390 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps45P97390 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps45P97390 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps45P97390 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps45P97390 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps45P97390 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps45P97390 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps45P97390 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps45P97390 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vps45P97390 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps45P97390 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps45P97390 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps45P97390 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps45P97390 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps45P97390 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps45P97390 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps45P97390 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps45P97390 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps45P97390 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps45P97390 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps45P97390 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps45P97390 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps45P97390 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps45P97390 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps45P97390 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps45P97390 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps45P97390 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps45P97390 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps45P97390 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps45P97390 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vps45P97390 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps45P97390 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms