Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cct3P80318 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cct3P80318 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cct3P80318 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cct3P80318 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cct3P80318 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cct3P80318 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cct3P80318 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cct3P80318 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cct3P80318 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cct3P80318 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cct3P80318 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cct3P80318 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cct3P80318 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cct3P80318 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cct3P80318 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cct3P80318 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cct3P80318 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cct3P80318 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cct3P80318 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cct3P80318 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cct3P80318 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cct3P80318 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cct3P80318 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cct3P80318 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cct3P80318 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cct3P80318 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cct3P80318 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cct3P80318 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cct3P80318 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cct3P80318 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cct3P80318 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cct3P80318 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cct3P80318 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cct3P80318 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cct3P80318 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cct3P80318 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cct3P80318 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cct3P80318 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cct3P80318 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cct3P80318 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cct3P80318 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cct3P80318 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cct3P80318 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cct3P80318 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cct3P80318 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cct3P80318 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cct3P80318 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cct3P80318 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cct3P80318 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cct3P80318 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cct3P80318 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cct3P80318 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cct3P80318 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cct3P80318 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cct3P80318 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cct3P80318 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cct3P80318 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cct3P80318 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cct3P80318 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cct3P80318 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cct3P80318 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cct3P80318 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cct3P80318 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cct3P80318 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cct3P80318 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cct3P80318 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cct3P80318 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cct3P80318 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Cct3P80318 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cct3P80318 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cct3P80318 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cct3P80318 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cct3P80318 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cct3P80318 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cct3P80318 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Cct3P80318 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cct3P80318 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms