Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Tp53bp1P70399 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tp53bp1P70399 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tp53bp1P70399 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tp53bp1P70399 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tp53bp1P70399 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tp53bp1P70399 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tp53bp1P70399 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tp53bp1P70399 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tp53bp1P70399 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tp53bp1P70399 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tp53bp1P70399 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tp53bp1P70399 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tp53bp1P70399 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tp53bp1P70399 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tp53bp1P70399 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tp53bp1P70399 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tp53bp1P70399 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tp53bp1P70399 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tp53bp1P70399 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tp53bp1P70399 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tp53bp1P70399 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tp53bp1P70399 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tp53bp1P70399 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tp53bp1P70399 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tp53bp1P70399 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tp53bp1P70399 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tp53bp1P70399 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tp53bp1P70399 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tp53bp1P70399 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tp53bp1P70399 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tp53bp1P70399 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Tp53bp1P70399 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tp53bp1P70399 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tp53bp1P70399 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tp53bp1P70399 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tp53bp1P70399 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tp53bp1P70399 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Tp53bp1P70399 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tp53bp1P70399 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tp53bp1P70399 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tp53bp1P70399 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tp53bp1P70399 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Tp53bp1P70399 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Tp53bp1P70399 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tp53bp1P70399 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tp53bp1P70399 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tp53bp1P70399 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tp53bp1P70399 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tp53bp1P70399 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Tp53bp1P70399 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Tp53bp1P70399 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tp53bp1P70399 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Tp53bp1P70399 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tp53bp1P70399 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tp53bp1P70399 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tp53bp1P70399 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tp53bp1P70399 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Tp53bp1P70399 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tp53bp1P70399 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tp53bp1P70399 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tp53bp1P70399 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tp53bp1P70399 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Tp53bp1P70399 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Tp53bp1P70399 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Tp53bp1P70399 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tp53bp1P70399 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Tp53bp1P70399 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tp53bp1P70399 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Tp53bp1P70399 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tp53bp1P70399 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tp53bp1P70399 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Tp53bp1P70399 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms