Protein–RNA interactions for Protein: P70362

Ufd1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufd1P70362 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ufd1P70362 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Ufd1P70362 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ufd1P70362 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ufd1P70362 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ufd1P70362 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ufd1P70362 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ufd1P70362 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ufd1P70362 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ufd1P70362 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ufd1P70362 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ufd1P70362 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ufd1P70362 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ufd1P70362 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ufd1P70362 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ufd1P70362 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ufd1P70362 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ufd1P70362 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ufd1P70362 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ufd1P70362 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ufd1P70362 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ufd1P70362 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ufd1P70362 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ufd1P70362 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ufd1P70362 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 359.7 ms