Protein–RNA interactions for Protein: P70324

Tbx3, T-box transcription factor TBX3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbx3P70324 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tbx3P70324 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tbx3P70324 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tbx3P70324 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tbx3P70324 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tbx3P70324 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tbx3P70324 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tbx3P70324 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tbx3P70324 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tbx3P70324 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tbx3P70324 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tbx3P70324 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tbx3P70324 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tbx3P70324 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tbx3P70324 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tbx3P70324 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tbx3P70324 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tbx3P70324 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tbx3P70324 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tbx3P70324 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tbx3P70324 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tbx3P70324 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tbx3P70324 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tbx3P70324 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tbx3P70324 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tbx3P70324 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tbx3P70324 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tbx3P70324 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Tbx3P70324 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tbx3P70324 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tbx3P70324 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbx3P70324 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbx3P70324 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tbx3P70324 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tbx3P70324 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tbx3P70324 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tbx3P70324 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbx3P70324 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbx3P70324 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbx3P70324 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbx3P70324 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbx3P70324 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbx3P70324 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tbx3P70324 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tbx3P70324 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tbx3P70324 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tbx3P70324 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tbx3P70324 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tbx3P70324 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tbx3P70324 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tbx3P70324 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tbx3P70324 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tbx3P70324 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tbx3P70324 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tbx3P70324 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tbx3P70324 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tbx3P70324 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tbx3P70324 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tbx3P70324 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tbx3P70324 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tbx3P70324 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tbx3P70324 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tbx3P70324 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tbx3P70324 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tbx3P70324 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tbx3P70324 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tbx3P70324 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tbx3P70324 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tbx3P70324 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tbx3P70324 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tbx3P70324 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tbx3P70324 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tbx3P70324 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tbx3P70324 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tbx3P70324 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tbx3P70324 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tbx3P70324 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms