Protein–RNA interactions for Protein: P70188

Kifap3, Kinesin-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifap3P70188 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kifap3P70188 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kifap3P70188 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kifap3P70188 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kifap3P70188 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kifap3P70188 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kifap3P70188 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kifap3P70188 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kifap3P70188 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kifap3P70188 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kifap3P70188 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kifap3P70188 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Kifap3P70188 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kifap3P70188 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kifap3P70188 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kifap3P70188 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kifap3P70188 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kifap3P70188 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kifap3P70188 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kifap3P70188 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kifap3P70188 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kifap3P70188 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kifap3P70188 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kifap3P70188 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kifap3P70188 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kifap3P70188 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Kifap3P70188 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kifap3P70188 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kifap3P70188 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Kifap3P70188 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Kifap3P70188 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kifap3P70188 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kifap3P70188 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kifap3P70188 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kifap3P70188 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kifap3P70188 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kifap3P70188 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kifap3P70188 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kifap3P70188 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kifap3P70188 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kifap3P70188 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kifap3P70188 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kifap3P70188 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kifap3P70188 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kifap3P70188 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Kifap3P70188 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kifap3P70188 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kifap3P70188 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kifap3P70188 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kifap3P70188 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kifap3P70188 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Kifap3P70188 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kifap3P70188 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kifap3P70188 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kifap3P70188 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kifap3P70188 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kifap3P70188 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Kifap3P70188 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kifap3P70188 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kifap3P70188 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kifap3P70188 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kifap3P70188 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kifap3P70188 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Kifap3P70188 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kifap3P70188 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kifap3P70188 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kifap3P70188 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kifap3P70188 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kifap3P70188 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kifap3P70188 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kifap3P70188 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kifap3P70188 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Kifap3P70188 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Kifap3P70188 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kifap3P70188 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kifap3P70188 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Kifap3P70188 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Kifap3P70188 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Kifap3P70188 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Kifap3P70188 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Kifap3P70188 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kifap3P70188 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kifap3P70188 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kifap3P70188 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kifap3P70188 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Kifap3P70188 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kifap3P70188 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Kifap3P70188 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Kifap3P70188 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Kifap3P70188 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kifap3P70188 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kifap3P70188 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kifap3P70188 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Kifap3P70188 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Kifap3P70188 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Kifap3P70188 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kifap3P70188 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kifap3P70188 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kifap3P70188 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Kifap3P70188 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms