Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PtnP63089 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtnP63089 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PtnP63089 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PtnP63089 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PtnP63089 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PtnP63089 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtnP63089 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PtnP63089 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtnP63089 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtnP63089 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtnP63089 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtnP63089 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtnP63089 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtnP63089 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtnP63089 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtnP63089 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtnP63089 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PtnP63089 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PtnP63089 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtnP63089 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtnP63089 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtnP63089 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PtnP63089 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtnP63089 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PtnP63089 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PtnP63089 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtnP63089 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtnP63089 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PtnP63089 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtnP63089 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtnP63089 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PtnP63089 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtnP63089 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtnP63089 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtnP63089 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PtnP63089 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtnP63089 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtnP63089 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PtnP63089 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtnP63089 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtnP63089 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtnP63089 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtnP63089 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtnP63089 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtnP63089 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PtnP63089 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtnP63089 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtnP63089 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtnP63089 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PtnP63089 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtnP63089 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtnP63089 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PtnP63089 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtnP63089 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtnP63089 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PtnP63089 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtnP63089 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtnP63089 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PtnP63089 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtnP63089 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtnP63089 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtnP63089 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PtnP63089 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtnP63089 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtnP63089 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtnP63089 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PtnP63089 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtnP63089 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtnP63089 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PtnP63089 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PtnP63089 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtnP63089 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtnP63089 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PtnP63089 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtnP63089 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtnP63089 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PtnP63089 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PtnP63089 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtnP63089 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PtnP63089 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtnP63089 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtnP63089 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtnP63089 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PtnP63089 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtnP63089 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PtnP63089 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PtnP63089 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PtnP63089 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtnP63089 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PtnP63089 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtnP63089 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtnP63089 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtnP63089 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtnP63089 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PtnP63089 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtnP63089 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtnP63089 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtnP63089 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PtnP63089 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms