Protein–RNA interactions for Protein: P60710

Actb, Actin, cytoplasmic 1, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ActbP60710 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
ActbP60710 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ActbP60710 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ActbP60710 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ActbP60710 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ActbP60710 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ActbP60710 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ActbP60710 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ActbP60710 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ActbP60710 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ActbP60710 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ActbP60710 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ActbP60710 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ActbP60710 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ActbP60710 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ActbP60710 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ActbP60710 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ActbP60710 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ActbP60710 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ActbP60710 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ActbP60710 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ActbP60710 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ActbP60710 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ActbP60710 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ActbP60710 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ActbP60710 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ActbP60710 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ActbP60710 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
ActbP60710 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ActbP60710 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
ActbP60710 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
ActbP60710 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
ActbP60710 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ActbP60710 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ActbP60710 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ActbP60710 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
ActbP60710 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
ActbP60710 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ActbP60710 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ActbP60710 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
ActbP60710 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ActbP60710 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
ActbP60710 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ActbP60710 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ActbP60710 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ActbP60710 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ActbP60710 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ActbP60710 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ActbP60710 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ActbP60710 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ActbP60710 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ActbP60710 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ActbP60710 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ActbP60710 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ActbP60710 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ActbP60710 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ActbP60710 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ActbP60710 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ActbP60710 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ActbP60710 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ActbP60710 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ActbP60710 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
ActbP60710 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ActbP60710 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
ActbP60710 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ActbP60710 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
ActbP60710 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ActbP60710 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ActbP60710 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ActbP60710 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ActbP60710 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ActbP60710 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ActbP60710 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ActbP60710 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ActbP60710 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ActbP60710 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ActbP60710 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ActbP60710 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ActbP60710 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ActbP60710 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ActbP60710 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ActbP60710 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ActbP60710 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ActbP60710 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ActbP60710 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ActbP60710 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ActbP60710 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ActbP60710 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ActbP60710 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ActbP60710 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ActbP60710 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ActbP60710 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ActbP60710 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ActbP60710 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ActbP60710 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ActbP60710 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ActbP60710 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ActbP60710 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ActbP60710 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ActbP60710 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms