Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rin3P59729 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rin3P59729 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rin3P59729 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rin3P59729 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rin3P59729 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Rin3P59729 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Rin3P59729 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Rin3P59729 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rin3P59729 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rin3P59729 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rin3P59729 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rin3P59729 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rin3P59729 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rin3P59729 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rin3P59729 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rin3P59729 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rin3P59729 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rin3P59729 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rin3P59729 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rin3P59729 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rin3P59729 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rin3P59729 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rin3P59729 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rin3P59729 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rin3P59729 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Rin3P59729 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rin3P59729 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rin3P59729 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rin3P59729 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rin3P59729 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rin3P59729 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rin3P59729 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Rin3P59729 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rin3P59729 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rin3P59729 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rin3P59729 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rin3P59729 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rin3P59729 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Rin3P59729 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rin3P59729 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rin3P59729 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rin3P59729 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rin3P59729 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rin3P59729 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rin3P59729 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rin3P59729 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rin3P59729 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rin3P59729 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Rin3P59729 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rin3P59729 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rin3P59729 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rin3P59729 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rin3P59729 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rin3P59729 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Rin3P59729 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rin3P59729 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rin3P59729 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rin3P59729 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rin3P59729 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rin3P59729 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rin3P59729 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rin3P59729 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rin3P59729 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rin3P59729 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rin3P59729 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rin3P59729 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rin3P59729 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Rin3P59729 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rin3P59729 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rin3P59729 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rin3P59729 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rin3P59729 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rin3P59729 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rin3P59729 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rin3P59729 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rin3P59729 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rin3P59729 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rin3P59729 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.9 ms