Protein–RNA interactions for Protein: P59438

Hps5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps5P59438 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hps5P59438 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hps5P59438 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hps5P59438 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hps5P59438 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hps5P59438 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hps5P59438 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hps5P59438 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hps5P59438 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hps5P59438 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hps5P59438 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hps5P59438 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hps5P59438 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hps5P59438 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hps5P59438 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hps5P59438 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hps5P59438 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hps5P59438 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hps5P59438 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hps5P59438 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Hps5P59438 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Hps5P59438 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hps5P59438 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hps5P59438 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hps5P59438 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hps5P59438 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hps5P59438 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Hps5P59438 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Hps5P59438 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hps5P59438 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hps5P59438 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hps5P59438 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hps5P59438 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Hps5P59438 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Hps5P59438 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hps5P59438 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hps5P59438 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hps5P59438 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hps5P59438 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hps5P59438 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Hps5P59438 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hps5P59438 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hps5P59438 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hps5P59438 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hps5P59438 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hps5P59438 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hps5P59438 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hps5P59438 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hps5P59438 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hps5P59438 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hps5P59438 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hps5P59438 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hps5P59438 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hps5P59438 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hps5P59438 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Hps5P59438 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hps5P59438 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hps5P59438 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hps5P59438 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hps5P59438 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Hps5P59438 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Hps5P59438 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hps5P59438 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Hps5P59438 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Hps5P59438 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Hps5P59438 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Hps5P59438 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hps5P59438 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hps5P59438 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hps5P59438 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Hps5P59438 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hps5P59438 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hps5P59438 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Hps5P59438 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hps5P59438 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hps5P59438 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hps5P59438 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Hps5P59438 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Hps5P59438 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms