Protein–RNA interactions for Protein: P59279

Rab2b, Ras-related protein Rab-2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab2bP59279 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab2bP59279 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab2bP59279 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab2bP59279 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab2bP59279 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Rab2bP59279 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab2bP59279 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab2bP59279 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab2bP59279 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Rab2bP59279 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab2bP59279 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Rab2bP59279 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab2bP59279 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab2bP59279 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab2bP59279 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab2bP59279 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab2bP59279 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Rab2bP59279 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Rab2bP59279 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab2bP59279 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab2bP59279 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rab2bP59279 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab2bP59279 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab2bP59279 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rab2bP59279 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab2bP59279 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rab2bP59279 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab2bP59279 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab2bP59279 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab2bP59279 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rab2bP59279 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab2bP59279 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rab2bP59279 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab2bP59279 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab2bP59279 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab2bP59279 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab2bP59279 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab2bP59279 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rab2bP59279 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rab2bP59279 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab2bP59279 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab2bP59279 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rab2bP59279 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rab2bP59279 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms