Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpaP58389 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PtpaP58389 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtpaP58389 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PtpaP58389 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtpaP58389 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtpaP58389 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PtpaP58389 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpaP58389 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpaP58389 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpaP58389 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpaP58389 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpaP58389 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpaP58389 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpaP58389 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PtpaP58389 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtpaP58389 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PtpaP58389 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PtpaP58389 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtpaP58389 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtpaP58389 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PtpaP58389 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtpaP58389 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtpaP58389 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtpaP58389 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtpaP58389 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtpaP58389 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtpaP58389 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PtpaP58389 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PtpaP58389 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtpaP58389 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PtpaP58389 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpaP58389 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpaP58389 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PtpaP58389 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtpaP58389 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PtpaP58389 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpaP58389 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpaP58389 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpaP58389 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpaP58389 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpaP58389 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtpaP58389 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpaP58389 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpaP58389 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtpaP58389 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpaP58389 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpaP58389 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpaP58389 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtpaP58389 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpaP58389 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpaP58389 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PtpaP58389 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpaP58389 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpaP58389 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpaP58389 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtpaP58389 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpaP58389 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpaP58389 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtpaP58389 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpaP58389 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpaP58389 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtpaP58389 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpaP58389 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpaP58389 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtpaP58389 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpaP58389 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpaP58389 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpaP58389 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtpaP58389 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtpaP58389 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtpaP58389 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtpaP58389 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtpaP58389 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtpaP58389 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtpaP58389 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms