Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Snrpa1P57784 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Snrpa1P57784 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Snrpa1P57784 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Snrpa1P57784 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Snrpa1P57784 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Snrpa1P57784 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Snrpa1P57784 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Snrpa1P57784 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Snrpa1P57784 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Snrpa1P57784 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Snrpa1P57784 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Snrpa1P57784 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Snrpa1P57784 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Snrpa1P57784 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Snrpa1P57784 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Snrpa1P57784 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Snrpa1P57784 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Snrpa1P57784 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Snrpa1P57784 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Snrpa1P57784 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Snrpa1P57784 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Snrpa1P57784 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Snrpa1P57784 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Snrpa1P57784 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Snrpa1P57784 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Snrpa1P57784 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Snrpa1P57784 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Snrpa1P57784 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Snrpa1P57784 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Snrpa1P57784 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Snrpa1P57784 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Snrpa1P57784 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Snrpa1P57784 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Snrpa1P57784 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Snrpa1P57784 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Snrpa1P57784 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Snrpa1P57784 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Snrpa1P57784 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Snrpa1P57784 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Snrpa1P57784 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Snrpa1P57784 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Snrpa1P57784 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Snrpa1P57784 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Snrpa1P57784 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Snrpa1P57784 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
Snrpa1P57784 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Snrpa1P57784 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Snrpa1P57784 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Snrpa1P57784 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Snrpa1P57784 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Snrpa1P57784 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Snrpa1P57784 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Snrpa1P57784 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Snrpa1P57784 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Snrpa1P57784 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Snrpa1P57784 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Snrpa1P57784 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Snrpa1P57784 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Snrpa1P57784 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Snrpa1P57784 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Snrpa1P57784 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Snrpa1P57784 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Snrpa1P57784 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Snrpa1P57784 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Snrpa1P57784 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Snrpa1P57784 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Snrpa1P57784 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Snrpa1P57784 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Snrpa1P57784 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Snrpa1P57784 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Snrpa1P57784 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Snrpa1P57784 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Snrpa1P57784 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Snrpa1P57784 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Snrpa1P57784 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Snrpa1P57784 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Snrpa1P57784 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Snrpa1P57784 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Snrpa1P57784 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Snrpa1P57784 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Snrpa1P57784 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Snrpa1P57784 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Snrpa1P57784 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Snrpa1P57784 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Snrpa1P57784 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Snrpa1P57784 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Snrpa1P57784 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Snrpa1P57784 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Snrpa1P57784 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Snrpa1P57784 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Snrpa1P57784 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Snrpa1P57784 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Snrpa1P57784 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Snrpa1P57784 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Snrpa1P57784 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Snrpa1P57784 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Snrpa1P57784 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Snrpa1P57784 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Snrpa1P57784 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms