Protein–RNA interactions for Protein: P56818

Bace1, Beta-secretase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bace1P56818 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Bace1P56818 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bace1P56818 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bace1P56818 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Bace1P56818 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Bace1P56818 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Bace1P56818 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Bace1P56818 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bace1P56818 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Bace1P56818 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Bace1P56818 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Bace1P56818 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bace1P56818 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bace1P56818 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Bace1P56818 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Bace1P56818 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Bace1P56818 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Bace1P56818 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bace1P56818 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Bace1P56818 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Bace1P56818 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Bace1P56818 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Bace1P56818 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Bace1P56818 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Bace1P56818 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Bace1P56818 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bace1P56818 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bace1P56818 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bace1P56818 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Bace1P56818 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bace1P56818 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Bace1P56818 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bace1P56818 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Bace1P56818 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Bace1P56818 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Bace1P56818 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Bace1P56818 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Bace1P56818 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Bace1P56818 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Bace1P56818 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Bace1P56818 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Bace1P56818 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Bace1P56818 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Bace1P56818 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Bace1P56818 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bace1P56818 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bace1P56818 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Bace1P56818 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Bace1P56818 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Bace1P56818 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Bace1P56818 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Bace1P56818 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bace1P56818 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bace1P56818 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bace1P56818 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Bace1P56818 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bace1P56818 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Bace1P56818 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Bace1P56818 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Bace1P56818 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Bace1P56818 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Bace1P56818 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bace1P56818 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bace1P56818 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Bace1P56818 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Bace1P56818 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Bace1P56818 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bace1P56818 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bace1P56818 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Bace1P56818 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bace1P56818 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Bace1P56818 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Bace1P56818 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bace1P56818 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bace1P56818 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Bace1P56818 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Bace1P56818 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bace1P56818 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Bace1P56818 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bace1P56818 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Bace1P56818 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bace1P56818 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bace1P56818 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bace1P56818 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Bace1P56818 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bace1P56818 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Bace1P56818 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bace1P56818 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Bace1P56818 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Bace1P56818 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Bace1P56818 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Bace1P56818 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bace1P56818 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Bace1P56818 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bace1P56818 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bace1P56818 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bace1P56818 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Bace1P56818 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bace1P56818 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Bace1P56818 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms