Protein–RNA interactions for Protein: P56567

Csta, Cystatin-A, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CstaP56567 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CstaP56567 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CstaP56567 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CstaP56567 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CstaP56567 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CstaP56567 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CstaP56567 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CstaP56567 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CstaP56567 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CstaP56567 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CstaP56567 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CstaP56567 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CstaP56567 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CstaP56567 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CstaP56567 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CstaP56567 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CstaP56567 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CstaP56567 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CstaP56567 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CstaP56567 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CstaP56567 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CstaP56567 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CstaP56567 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CstaP56567 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CstaP56567 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CstaP56567 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CstaP56567 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CstaP56567 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CstaP56567 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CstaP56567 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CstaP56567 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CstaP56567 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CstaP56567 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CstaP56567 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CstaP56567 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CstaP56567 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CstaP56567 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CstaP56567 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CstaP56567 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CstaP56567 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CstaP56567 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CstaP56567 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CstaP56567 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CstaP56567 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CstaP56567 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CstaP56567 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CstaP56567 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CstaP56567 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CstaP56567 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CstaP56567 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CstaP56567 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CstaP56567 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CstaP56567 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CstaP56567 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CstaP56567 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CstaP56567 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CstaP56567 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CstaP56567 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CstaP56567 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CstaP56567 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CstaP56567 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CstaP56567 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CstaP56567 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CstaP56567 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CstaP56567 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CstaP56567 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CstaP56567 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CstaP56567 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CstaP56567 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CstaP56567 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CstaP56567 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CstaP56567 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CstaP56567 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CstaP56567 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CstaP56567 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CstaP56567 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CstaP56567 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CstaP56567 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CstaP56567 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CstaP56567 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CstaP56567 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CstaP56567 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CstaP56567 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CstaP56567 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CstaP56567 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CstaP56567 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CstaP56567 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CstaP56567 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CstaP56567 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CstaP56567 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CstaP56567 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CstaP56567 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CstaP56567 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CstaP56567 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CstaP56567 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CstaP56567 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CstaP56567 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CstaP56567 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CstaP56567 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CstaP56567 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.4 ms