Protein–RNA interactions for Protein: P54846

Nrl, Neural retina-specific leucine zipper protein, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrlP54846 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NrlP54846 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NrlP54846 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NrlP54846 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NrlP54846 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NrlP54846 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NrlP54846 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NrlP54846 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NrlP54846 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NrlP54846 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NrlP54846 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NrlP54846 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NrlP54846 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NrlP54846 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NrlP54846 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NrlP54846 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NrlP54846 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NrlP54846 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NrlP54846 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NrlP54846 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrlP54846 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrlP54846 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NrlP54846 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NrlP54846 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NrlP54846 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NrlP54846 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NrlP54846 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NrlP54846 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NrlP54846 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NrlP54846 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NrlP54846 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NrlP54846 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NrlP54846 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NrlP54846 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NrlP54846 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NrlP54846 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NrlP54846 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NrlP54846 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NrlP54846 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NrlP54846 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NrlP54846 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NrlP54846 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NrlP54846 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrlP54846 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NrlP54846 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NrlP54846 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NrlP54846 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
NrlP54846 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NrlP54846 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NrlP54846 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
NrlP54846 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NrlP54846 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NrlP54846 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
NrlP54846 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NrlP54846 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NrlP54846 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NrlP54846 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NrlP54846 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NrlP54846 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NrlP54846 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
NrlP54846 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NrlP54846 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NrlP54846 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NrlP54846 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NrlP54846 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NrlP54846 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NrlP54846 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NrlP54846 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
NrlP54846 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NrlP54846 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NrlP54846 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NrlP54846 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
NrlP54846 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NrlP54846 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NrlP54846 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NrlP54846 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NrlP54846 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NrlP54846 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NrlP54846 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
NrlP54846 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NrlP54846 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NrlP54846 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NrlP54846 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NrlP54846 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NrlP54846 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NrlP54846 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NrlP54846 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NrlP54846 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NrlP54846 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NrlP54846 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NrlP54846 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NrlP54846 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NrlP54846 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NrlP54846 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NrlP54846 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NrlP54846 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NrlP54846 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
NrlP54846 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NrlP54846 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NrlP54846 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms