Protein–RNA interactions for Protein: P52793

Efna1, Ephrin-A1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna1P52793 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efna1P52793 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efna1P52793 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna1P52793 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efna1P52793 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efna1P52793 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efna1P52793 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efna1P52793 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Efna1P52793 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efna1P52793 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efna1P52793 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Efna1P52793 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Efna1P52793 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Efna1P52793 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efna1P52793 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efna1P52793 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Efna1P52793 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efna1P52793 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Efna1P52793 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Efna1P52793 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Efna1P52793 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efna1P52793 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Efna1P52793 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efna1P52793 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efna1P52793 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efna1P52793 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efna1P52793 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Efna1P52793 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Efna1P52793 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Efna1P52793 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Efna1P52793 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efna1P52793 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efna1P52793 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efna1P52793 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efna1P52793 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Efna1P52793 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna1P52793 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna1P52793 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Efna1P52793 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efna1P52793 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Efna1P52793 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efna1P52793 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efna1P52793 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efna1P52793 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Efna1P52793 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efna1P52793 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efna1P52793 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Efna1P52793 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efna1P52793 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efna1P52793 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Efna1P52793 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efna1P52793 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Efna1P52793 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Efna1P52793 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Efna1P52793 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms